Marcadores de peso molecular

Los marcadores de peso molecular, o ladders, son un conjunto de estándares que se utilizan para determinar el tamaño aproximado de una proteína o un de fragmento de ácido nucleico procesado en un gel de electroforesis. Estos estándares contienen fragmentos (o proteínas) de tamaños y concentraciones predeterminadas. Cuando los marcadores se cargan en carriles adyacentes a las muestras, es fácil determinar el tamaño y la concentración de los fragmentos o proteínas de la muestra.

Los ladders de ADN contienen fragmentos de ADN de distintos tamaños. A veces, estos ladders se fabrican mediante la digestión con enzimas de restricción de un ADN plasmídico de secuencia conocida. A menudo, los marcadores de peso molecular y los ladders de ADN están disponibles en dos formatos: premezclados con colorante de carga, o con el colorante de carga por separado.

Los Step Ladders de ADN contienen bandas de ADN de tamaños definidos e igual intensidad con longitudes de fragmentos a intervalos definidos. Por ejemplo, los fragmentos de ADN de los step ladders pueden presentarse con incrementos de 100pb, que van desde 100pb hasta 4000pb. Los Step Ladders no están diseñados para realizar estimaciones de concentración. Son ideales cuando se desea verificar la longitud del fragmento de forma más específica de lo que se puede deducir mediante un ladder estándar con incrementos amplios o menos consistentes.

Al igual que los ladders de ADN, los ladders de ARN contienen fragmentos de ARN de distintos tamaños. Para determinar el tamaño de los fragmentos, el ARN suele pasarse por un gel de electroforesis desnaturalizante. Dado que el ARN migra más rápido que el ADN a través de los geles de electroforesis, debe utilizarse el ladder del ácido nucleico adecuado (ARN vs ADN).

Los marcadores de peso molecular de proteínas consisten en proteínas cuyo peso se mide en kDa. Se utilizan sobre todo en SDS-PAGE y western blotting. Los marcadores de peso molecular de proteínas se utilizan a veces como control para verificar la migración de proteínas y observar la eficacia de la transferencia.